尖锐湿疣多发生在生殖器、肛周等部位，疣体呈菜花状等；寻常疣好发于手部，疣体表面粗糙。
首先看发病部位，尖锐湿疣常出现在私密的生殖器、肛周区域，而寻常疣大多长在手部位。其次看疣体形态，尖锐湿疣疣体通常是菜花状、乳头状等，寻常疣表面比较粗糙，像刺一样。再者，病因也有不同，尖锐湿疣由HPV6、11型等感染引起，寻常疣多由HPV2型感染导致。
另外，尖锐湿疣有性传播的可能，寻常疣主要是直接或间接接触传播。而且两者的治疗方式也有差异，针对不同情况需采取不同处理办法。
在临床表现上，尖锐湿疣的疣体湿润柔软，寻常疣则相对坚硬些。通过这些方面可以较好地鉴别尖锐湿疣和寻常疣。
