龟头炎多由炎症刺激等引起，表现为龟头红肿、疼痛等；尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染所致，多有菜花状等赘生物。
首先，龟头炎主要是局部炎症反应，会有龟头的红肿、瘙痒、疼痛等症状，一般是因卫生不佳、局部刺激等引发。而尖锐湿疣是感染了特定病毒，会在生殖器部位出现菜花样、乳头状的赘生物，多通过性接触传播。其次，龟头炎经过抗感染等对症治疗，恢复相对较快；尖锐湿疣治疗相对复杂，需要针对病毒进行处理。再者，龟头炎做相关检查时，一般无病毒感染证据；尖锐湿疣则可检测出人乳头瘤病毒。
另外，龟头炎的治疗以抗炎等为主，保持局部清洁很重要；尖锐湿疣需要采用抗病毒、去除疣体等综合治疗手段。
还有，龟头炎一般不会有新增的异常增生物，而尖锐湿疣会有新的赘生物逐渐出现或增多。
