足疣是由人类乳头瘤病毒1、2、4型引起，多发生在足底；尖锐湿疣主要由HPV6、11型等引起，好发于生殖器及肛周部位。
首先，足疣一般表现为足底角化性丘疹，表面粗糙，受压时可能有疼痛感。而尖锐湿疣通常是淡红色小丘疹，逐渐增大增多，呈菜花状、乳头状等外观，好发部位不同。其次，足疣的发病部位相对固定在足底等部位，尖锐湿疣则多见于生殖器周围等性接触相关部位。另外，两者的病毒亚型也有差异，导致临床表现和好发部位不同。
再者，足疣的治疗多针对足底局部，采用物理治疗等方法。尖锐湿疣治疗除了局部处理，还需考虑防止复发等情况，因为其与性传播相关。
最后，从传播途径看，足疣主要通过接触污染的物品等传播，尖锐湿疣主要通过性接触传播。
