足疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染足部皮肤引起，尖锐湿疣主要通过性接触感染，好发于生殖器等部位。
首先，足疣多发生在足底等部位，表面粗糙，有黑色小点，走路可能有压痛。而尖锐湿疣好发于生殖器、肛周等，疣体通常呈菜花状、乳头状。其次，足疣的HPV亚型与尖锐湿疣的亚型不同，传播途径也有差异，足疣主要是接触污染的物品等感染，尖锐湿疣主要通过性传播。再者，治疗方法上，足疣可通过冷冻、激光等物理治疗，尖锐湿疣除物理治疗外，还可能需配合抗病毒等综合治疗。
另外，足疣一般不会出现在生殖器等部位，而尖锐湿疣典型部位是生殖器周围。在临床表现上，足疣的症状相对局限于足部皮肤，尖锐湿疣则更具性传播疾病的特征性表现。
从发病机制来说，两者都是HPV感染，但感染部位和引发的局部组织反应有区别，足疣引起足部皮肤的增生，尖锐湿疣引起生殖器等部位的特殊形态病变。
