珍珠丘疹一般呈珍珠状、排列规则，尖锐湿疣则多为菜花状、乳头状且有不洁性接触史等。
首先看形态，珍珠丘疹通常是环绕龟头的淡红色小丘疹，表面光滑；而尖锐湿疣初起为细小淡红色丘疹，后逐渐增大增多，形态多样。其次看生长速度，珍珠丘疹生长缓慢，长时间无明显变化；尖锐湿疣生长相对较快。再者看接触史，珍珠丘疹与性接触无关，尖锐湿疣往往有不洁性接触史。
另外，珍珠丘疹醋酸白试验呈阴性，尖锐湿疣醋酸白试验多呈阳性。还有，珍珠丘疹一般无自觉症状，尖锐湿疣可能会有瘙痒、灼痛等不适。
从发病部位来说，珍珠丘疹主要在龟头冠状沟部位；尖锐湿疣可出现在生殖器、肛周等多个部位。
