尖锐湿疣多有菜花状、乳头状赘生物，毛囊炎则是毛囊部位的红肿痛小疙瘩。
首先看外观，尖锐湿疣通常是单个或多个凸起，形状不规则，像菜花或乳头。而毛囊炎一般是毛囊周围发红、肿胀，有疼痛的小疙瘩。其次，尖锐湿疣好发于生殖器等部位，有不洁性接触史可能相关。毛囊炎多因毛囊感染细菌等引起，皮肤清洁不到位等易诱发。再者，尖锐湿疣一般无明显疼痛，毛囊炎常有明显疼痛感觉。
另外，尖锐湿疣生长较慢，会逐渐增多增大。毛囊炎若处理得当，一般恢复较快。通过这些不同表现来区分两者。
还可以从发病原因进一步区分，尖锐湿疣主要由人乳头瘤病毒感染所致。毛囊炎主要是细菌等病原体感染毛囊引发。
