珍珠疣多环绕阴茎冠状沟，呈珍珠状小丘疹；尖锐湿疣常是菜花状、乳头状赘生物，多与不洁性接触有关。
首先，珍珠疣一般颜色较淡，排列整齐，无明显不适；而尖锐湿疣形态多样，生长速度可能较快，常伴有瘙痒、疼痛等症状。其次，珍珠疣通常是良性病变，对健康影响小；尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起，有传染性。再者，珍珠疣一般无需特殊治疗，尖锐湿疣需积极治疗。
从发病原因看，珍珠疣病因不明，可能与生理发育等有关；尖锐湿疣主要通过性接触传播。另外，珍珠疣好发于青壮年男性冠状沟部位；尖锐湿疣可出现在生殖器及肛周等多种部位。
