尿道尖锐湿疣部分患者会有疼痛感，部分患者可能无明显痛感。
首先，疣体较小且数量少的时候，可能仅感觉尿道有异物感，不一定有明显疼痛。其次，当疣体逐渐增大、增多，刺激尿道黏膜时，就可能出现刺痛、灼痛等感觉。另外，若合并感染等情况，疼痛可能会更明显。
还有一种情况是，个体对疼痛的敏感程度不同，有的患者即使疣体有一定程度发展，疼痛表现也不显著，但有的患者就会较明显感觉到尿道部位的疼痛不适。
总体来说，尿道尖锐湿疣是否疼痛存在个体差异，与疣体的大小、数量、是否合并感染以及患者自身对疼痛的耐受程度等多种因素有关。
