黑痣通常是皮肤上的黑色斑块，边界清晰，一般不会有不适症状；尖锐湿疣多发生在生殖器等部位，呈菜花状、乳头状等异常赘生物。
首先看形态，黑痣形状较规则，颜色相对均匀；而尖锐湿疣形状多样，常呈突起的赘生物。其次看生长部位，黑痣可长在身体任何部位；尖锐湿疣好发于生殖器、肛周等特定部位。再者，黑痣一般不会自行变化或增多，尖锐湿疣可能会逐渐增大、增多。
从触感来说，黑痣触感与周围皮肤相似；尖锐湿疣触感可能较为粗糙，有突起感。另外，黑痣一般不需要特殊处理，而尖锐湿疣需要及时就医治疗。
还可以通过病史来辅助判断，若有不洁性行为史，出现疑似赘生物要考虑尖锐湿疣；单纯皮肤出现黑色斑块多考虑黑痣。
