疖肿多由细菌感染引起，尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染所致，可从病因、症状表现等方面区分。
首先看病因，疖肿主要是金黄色葡萄球菌等细菌感染毛囊及周围组织引发；而尖锐湿疣是感染人乳头瘤病毒（HPV）导致。其次看症状，疖肿通常是单个红肿疼痛的小硬结，逐渐化脓；尖锐湿疣则是淡红色小丘疹，逐渐增大呈菜花状、乳头状等外观。再者，发病部位也有差异，疖肿可发生在身体任何有毛囊的部位；尖锐湿疣好发于生殖器、肛周等部位。
另外，疖肿一般经抗感染治疗可好转；尖锐湿疣需要针对HPV进行抗病毒等治疗，且易复发。还有，从生长速度来看，疖肿生长相对较快但有炎症表现；尖锐湿疣生长速度较慢，多有逐渐增多增大的特点。
