疖子是细菌感染引起的，尖锐湿疣是病毒感染导致的，二者病因、症状等方面有明显不同。
首先，疖子多发生在毛囊及周围组织，表现为红肿热痛的小结节，逐渐肿大，顶部有黄白色脓点。而尖锐湿疣好发于生殖器等部位，初起为细小淡红色丘疹，后逐渐增大增多，表面凹凸不平。其次，疖子一般是单个出现，通过抗感染治疗可好转。尖锐湿疣常呈菜花状、乳头状等外观，有传染性，需抗病毒等特殊治疗。再者，疖子是细菌性炎症，尖锐湿疣是病毒性疾病，发病机制完全不一样。
另外，疖子的治疗主要是局部消毒、使用抗生素等，而尖锐湿疣需要采用如激光、冷冻等特定的去除疣体的方法，同时配合抗病毒等综合治疗。
还有，从发病原因看，疖子是皮肤受到金黄色葡萄球菌等细菌侵入感染引发，尖锐湿疣是感染人乳头瘤病毒所致。
