珍珠粒一般无不适症状，呈珍珠状小丘疹；尖锐湿疣多有菜花状、乳头状赘生物，且可能有瘙痒、疼痛等不适。
首先看形态，珍珠粒通常大小均匀，排列规则；而尖锐湿疣形态多样，常呈不规则的突起。其次看生长部位，珍珠粒好发于阴茎冠状沟等部位；尖锐湿疣可出现在生殖器、肛周等多种部位。再者看症状表现，珍珠粒一般没有明显自觉症状；尖锐湿疣可能会有局部的不适感。
另外，珍珠粒生长较为缓慢，长时间变化不大；尖锐湿疣生长速度相对较快，赘生物可能会逐渐增大增多。
还有，珍珠粒醋酸白试验通常呈阴性；尖锐湿疣醋酸白试验多呈阳性。
