尖锐湿疣主要是生殖器等部位出现菜花状、乳头状赘生物；梅毒有硬下疳、梅毒疹等不同阶段表现。
首先，尖锐湿疣由人乳头瘤病毒感染引起，损害多为凸起的疣体，外观呈疣状。而梅毒是梅毒螺旋体感染所致，一期梅毒会出现单个无痛的硬下疳。其次，尖锐湿疣一般不会有全身症状，梅毒二期会有全身多部位的梅毒疹等表现。再者，尖锐湿疣主要通过性接触传播，梅毒除性接触外，还可通过母婴、血液等传播。
另外，尖锐湿疣的治疗常需去除疣体并防复发，梅毒则需用青霉素等药物规范驱梅治疗。
还有，尖锐湿疣的疣体组织病理可见特征性空泡细胞，梅毒血清学检查可确诊。
