尖锐湿疣通常是菜花样、鸡冠样的赘生物，而珍珠疹多是环绕阴茎冠状沟的珍珠状半透明小丘疹。
首先看形态，尖锐湿疣形态多样且常逐渐增大增多，珍珠疹则比较规则且长期无明显变化。其次看生长部位，尖锐湿疣可出现在生殖器其他部位，珍珠疹主要集中在冠状沟部位。再者看发展速度，尖锐湿疣生长速度相对较快，珍珠疹一般稳定无快速变化。
从病因来讲，尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起，具有传染性，珍珠疹可能与生理发育变异等非传染性因素有关。
另外，通过醋酸白试验等辅助检查也可辅助区分，尖锐湿疣醋酸白试验多呈阳性，珍珠疹则为阴性。
