尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）6、11型等引起，多发生在生殖器等部位；丝状疣是由HPV-2型等引起，好发于颈部等部位。
首先，病因方面，尖锐湿疣主要与特定亚型HPV感染相关，丝状疣则是另一些亚型HPV导致。其次，发病部位，尖锐湿疣常见于外生殖器、肛周等性接触相关部位，丝状疣多在颈部、眼睑等皮肤薄嫩处。再者，疣体形态，尖锐湿疣疣体常呈菜花状、乳头状等，丝状疣一般是单个细软的丝状突起。
另外，传播途径有差异，尖锐湿疣主要通过性接触传播，丝状疣可通过直接接触或间接接触传播，比如接触被污染的物品等。
还有，治疗方式也不完全相同，不过都需要针对HPV感染进行处理，只是具体方法会因疣体部位等有所不同。
