可从症状表现、生长部位等方面来分辨，痔疮多有便血、脱出等表现，尖锐湿疣多为丘疹状等新生物且与性传播相关。
首先看症状，痔疮便血一般是鲜红色，点滴状或喷射状，尖锐湿疣通常是淡红色小丘疹，逐渐增多增大。其次看生长部位，痔疮好发于肛门周围，尖锐湿疣常出现在生殖器及肛周等部位。再者，尖锐湿疣有不洁性接触史的可能性大，而痔疮多与饮食、排便习惯等有关。
另外，痔疮一般不会有明显的菜花样改变，尖锐湿疣可能会出现菜花状、鸡冠样的赘生物。还有，痔疮通过坐浴、涂抹药膏等保守治疗多有缓解，尖锐湿疣需进行抗病毒等特殊治疗。
还有一点，痔疮的脱出物多能还纳，尖锐湿疣的赘生物不易还纳且易出血。
