珍珠疹一般环绕阴茎冠状沟，呈排列整齐的小丘疹，而尖锐湿疣多为菜花状、乳头状等异常赘生物且有不洁性接触史等。
首先看形态，珍珠疹通常是均匀一致的小丘疹，大小较固定。而尖锐湿疣形态多样，可能会逐渐增大增多。其次看生长速度，珍珠疹生长缓慢，长时间无明显变化。尖锐湿疣生长相对较快。另外，珍珠疹一般无不适症状，尖锐湿疣可能会有瘙痒、异物感等。
再从发病情况来说，珍珠疹多见于青壮年，是正常生理变异。尖锐湿疣主要通过性接触传播，有不洁性行为后易发病。
还有鉴别方法，可到医院让医生通过醋酸白试验等辅助检查来准确区分，醋酸白试验下珍珠疹一般不变白，尖锐湿疣多会变白。
