尖锐湿疣通常是凸起的菜花样、鸡冠样赘生物，肛周湿疹多是皮肤红斑、丘疹、瘙痒等表现但无明显赘生物。
首先看外观，尖锐湿疣有独特的赘生物形态，而肛周湿疹主要是皮肤的炎症改变。其次，尖锐湿疣一般有不洁性接触史相关可能，肛周湿疹多与局部潮湿、过敏等因素有关。再者，尖锐湿疣生长较缓慢且逐渐增多增大，肛周湿疹症状相对更易因刺激等因素变化。
从症状感受来说，尖锐湿疣一般无明显瘙痒或有轻微异物感，肛周湿疹则以剧烈瘙痒为突出表现。另外，实验室检查也可辅助区分，如醋酸白试验等对尖锐湿疣有特定意义。
治疗上也有区别，尖锐湿疣多需去除疣体等治疗，肛周湿疹主要是抗炎、止痒等对症处理。
