肛内尖锐湿疣通常是淡红色小丘疹，逐渐增多变大，呈菜花状等；痔疮一般是暗紫色团块，常有便血且血色鲜红。
首先看外观，肛内尖锐湿疣多为不规则的赘生物，表面不光滑。而痔疮外观相对规则些。其次看症状表现，肛内尖锐湿疣可能有异物感、瘙痒等，痔疮主要是便血、脱出等。另外，病史也有区别，尖锐湿疣多有不洁性接触史，痔疮多因久坐、便秘等引起。
从生长特点看，肛内尖锐湿疣会不断生长扩散，而痔疮一般相对稳定。再者，通过病理检查能更准确区分，病理下尖锐湿疣有特征性病变，痔疮则是血管等组织的改变。
在治疗上也不同，肛内尖锐湿疣需抗病毒等治疗，痔疮多采用保守或手术等针对血管等的治疗。
