尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起，主要表现为生殖器等部位的疣状赘生物；梅毒是由梅毒螺旋体感染所致，病程分多期，症状多样。
首先，病因不同，尖锐湿疣由人乳头瘤病毒引发，梅毒是梅毒螺旋体作祟。其次，症状表现有别，尖锐湿疣多是生殖器等部位出现菜花状、乳头状疣体；梅毒一期会有硬下疳，二期有梅毒疹等多种表现。再者，病程发展不一样，尖锐湿疣病程相对多样，梅毒有明确的一期、二期、三期等不同阶段。
另外，诊断方法也有差异，尖锐湿疣可通过外观、醋酸白试验等辅助诊断；梅毒需依靠血清学检查等确诊。治疗上，尖锐湿疣多采用去除疣体等方法，梅毒则主要用青霉素等药物进行驱梅治疗。
