肛门尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起，多有不洁性生活史，表现为肛门周围菜花样、乳头状赘生物；痔疮是由于肛管或直肠下端静脉丛充血或瘀血并肿大，常见症状为便血、脱出等，病因与久坐、便秘等有关。
首先看外观，尖锐湿疣通常是形态不规则、表面凹凸不平的赘生物，而痔疮一般是柔软的团块，除非有血栓形成等情况才会变硬。其次，尖锐湿疣多有接触病毒的途径，比如不洁性行为，而痔疮往往是因肛肠局部血液循环等问题导致。再者，尖锐湿疣一般有逐渐增多增大的趋势，痔疮的症状相对较稳定，但也可能因诱因变化而加重。
从症状表现来说，尖锐湿疣可能伴有瘙痒、异物感等，而痔疮主要是便血，便血颜色鲜红，可呈点滴状或喷射状，同时可能有肛门肿物脱出等情况。
在治疗方法上也不同，尖锐湿疣需要抗病毒等治疗，而痔疮多采用保守治疗如坐浴、用药等，严重时才考虑手术。
