丝状疣多为单个细软丝状突起，常发生在颈部等部位；尖锐湿疣则多为菜花状、鸡冠样等外观，好发于生殖器等部位。
首先，丝状疣一般颜色与皮肤相近，形态是细长的丝状；而尖锐湿疣外形多样，常呈赘生物状，且好发部位不同。其次，丝状疣传染性相对较弱，尖锐湿疣是性传播疾病的一种，传染性较强。再者，丝状疣生长较缓慢，尖锐湿疣生长速度可能相对快些。
另外，丝状疣通过局部治疗等方法较易去除；尖锐湿疣治疗相对复杂，需要综合多种手段。而且两者的发病原因也有差异，丝状疣主要由人类乳头瘤病毒特定亚型感染引起，尖锐湿疣主要由低危型和高危型HPV感染所致。
