珍珠疹一般是环绕阴茎冠状沟的淡红色小丘疹，而尖锐湿疣多为菜花状、乳头状等赘生物，生长速度可能较快。
首先看形态，珍珠疹通常大小均匀，排列规则。尖锐湿疣则形态多样，可能有突起且表面不光滑。其次看生长速度，珍珠疹一般长期无明显变化，尖锐湿疣可能会逐渐增大、增多。另外，珍珠疹多是生理性变异，尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病。
再从发病部位来看，珍珠疹主要在冠状沟部位，尖锐湿疣可出现在生殖器其他部位，如龟头、尿道口等。而且珍珠疹一般无自觉症状，尖锐湿疣可能会有瘙痒、异物感等。
还有实验室检查方面，通过醋酸白试验等可以辅助鉴别，不过最终准确判断需要专业医生结合多种方法。
