珍珠疹一般无不适症状，多环绕阴茎冠状沟排列；尖锐湿疣多有不洁性接触史，疣体呈菜花状、乳头状等。
首先看形态，珍珠疹通常是均匀一致的小丘疹，排列规则。而尖锐湿疣的疣体形态多样，常呈不规则的突起。其次看生长速度，珍珠疹生长缓慢，长时间无明显变化。尖锐湿疣生长相对较快，可能会迅速增大增多。再者看接触史，珍珠疹与性接触无关，尖锐湿疣往往有不洁性接触史。
另外，珍珠疹一般不会引起瘙痒、疼痛等不适感觉。尖锐湿疣可能会有局部的瘙痒、异物感等。还有，通过醋酸白试验也可辅助区分，珍珠疹醋酸白试验阴性，尖锐湿疣醋酸白试验多呈阳性。
