阴部毛囊炎多是细菌感染引起，表现为红色丘疹伴疼痛；尖锐湿疣是病毒感染，表现为菜花状、乳头状赘生物。
首先看症状表现，毛囊炎一般是单个或多个红色充实性丘疹，有疼痛感；而尖锐湿疣初起多为细小淡红色丘疹，逐渐增大增多，形态多样。其次病因不同，毛囊炎主要由金黄色葡萄球菌等细菌感染所致；尖锐湿疣是感染人乳头瘤病毒（HPV）引起。再者发展特点，毛囊炎经抗炎治疗多可好转；尖锐湿疣易复发，传播性较强。
从发病部位看，两者都可在阴部，但毛囊炎还可能出现在其他有毛发部位；尖锐湿疣主要好发于生殖器及肛周等部位。另外，毛囊炎一般不会有传染性，而尖锐湿疣具有传染性，可通过性接触等传播。
