阴茎癌多有肿物逐渐增大、溃疡经久不愈等表现，而阴茎尖锐湿疣多为菜花状、乳头状赘生物，有不洁性接触史等。
首先看外观，阴茎癌的肿物通常形态不规则，边界不清，可能有溃疡、出血等；阴茎尖锐湿疣一般是淡红色或灰色的赘生物，呈菜花或乳头状。其次，病史方面，阴茎尖锐湿疣往往有不洁性生活史，而阴茎癌多无此明确接触史。再者，生长速度，阴茎癌生长相对较快，阴茎尖锐湿疣生长速度相对较慢。
另外，病理检查是金标准，取病变组织做病理，阴茎癌可发现癌细胞，阴茎尖锐湿疣则是乳头瘤样增生等表现。
还有，症状表现，阴茎癌可能伴有疼痛、恶臭等，阴茎尖锐湿疣一般局部瘙痒等症状相对不重。
