动脉瘤样骨囊肿的病因尚未完全明确，目前研究提示可能与遗传突变、创伤、内分泌调节异常及继发于其他骨病变等因素相关。
一、遗传因素
遗传因素方面，部分研究发现USP6基因的染色体易位或异常表达可能参与发病，这类基因变异可能影响骨细胞的增殖与分化调控，导致骨组织局部异常增生并形成囊肿结构。青少年患者中，因遗传因素导致的ABC可能更常见，且家族中有类似骨病变史者需警惕遗传倾向。
二、创伤因素
创伤因素被认为是重要诱因之一，反复或长期的局部创伤可能破坏骨内血管结构，导致血流动力学改变和局部血肿形成，长期慢性刺激可诱发骨组织异常修复，进而形成动脉瘤样骨囊肿。从事高风险职业（如运动员、建筑工人）或有既往骨损伤史者，因局部创伤累积风险增加，需加强防护。
三、内分泌因素
内分泌调节异常也可能参与发病，甲状旁腺激素相关蛋白等激素水平变化可能通过影响破骨细胞与成骨细胞的平衡，改变骨重塑微环境，诱发囊肿形成。女性患者中，青春期内分泌波动期（如月经周期、妊娠期）可能因激素变化导致ABC风险相对升高，需关注相关内分泌指标监测。
四、继发于其他骨病变
部分ABC可继发于骨巨细胞瘤、骨化性纤维瘤等骨病变，原发病变导致的局部微环境改变（如细胞因子异常分泌）可能促进囊肿形成。有骨巨细胞瘤等病史者，需定期复查影像学检查，早期发现ABC继发风险。
