手术不能彻底根治萎缩性胃炎。目前尚无手术能完全逆转萎缩性胃炎进程，治疗以药物、生活方式干预及定期监测为主。
对于轻度萎缩性胃炎，主要通过根除幽门螺杆菌、补充维生素B12和叶酸、使用胃黏膜保护剂等药物控制进展。
中度萎缩性胃炎需在药物治疗基础上，严格戒烟戒酒，避免长期服用非甾体抗炎药，定期复查胃镜及病理活检。
重度萎缩性胃炎（伴肠化或异型增生）患者，建议每6~12个月复查胃镜，必要时考虑内镜下黏膜剥离术等微创治疗。
特殊人群如老年患者应加强营养支持，糖尿病患者需严格控制血糖，孕妇应优先选择安全药物，哺乳期女性需咨询医生后用药。
