尼帕病毒对人类危害极大。
该病毒具有高致病性，可直接侵袭中枢神经系统，引发严重脑炎，患者初期头痛、发热，迅速进展为嗜睡、昏迷，脑水肿和颅内压升高是常见并发症，严重时可致脑疝形成，危及生命。同时，病毒攻击肺部组织，引发急性呼吸窘迫综合征，导致呼吸困难、低氧血症，重症患者常因呼吸循环衰竭死亡。此外，病毒血症可引发全身炎症风暴，累及心、肝、肾等多器官，造成多器官功能衰竭。
即便幸存，约20%患者会遗留癫痫、认知障碍等不可逆神经损伤，且目前尚无特效治疗药物和疫苗，病死率高达40%—75%，严重威胁人类生命健康。
