长期在医生指导下使用他达拉非通常较为安全，但并非毫无风险。
其副作用大多轻微可控，但少数情况下可能出现严重不良反应。常见的副作用包括头痛、面部潮红、鼻塞、消化不良、背痛和肌肉酸痛等，这些反应通常是暂时的，在用药初期或剂量调整时可能出现，身体适应后往往会减轻或消失。
然而，极少数情况下，长期使用他达拉非可能导致阴茎异常勃起、突发性的视力丧失或听力下降等严重问题。对于本身存在心血管疾病隐患的患者，还可能出现心绞痛、心律不齐甚至心肌梗死。
因此，用药期间必须密切关注身体反应，出现任何异常信号应立即停药并就医。
