卵巢囊肿多数情况可以做微创手术，尤其是直径≤5cm的良性囊肿，腹腔镜手术是常用方式。
对于生理性囊肿（如滤泡囊肿），一般无需手术，可观察2-3个月经周期，部分会自行消退。
卵巢囊肿直径>5cm或持续存在，怀疑恶性或交界性病变时，建议手术治疗，腹腔镜手术可作为优先选择，具有创伤小、恢复快的优势。
子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）若体积较大，也可考虑腹腔镜手术，术后复发率较低，但需结合患者生育需求综合评估。
特殊人群如妊娠期女性，需优先保守观察，避免过度干预影响妊娠；老年患者若囊肿性质不明，需更谨慎评估手术风险。
