肛瘘主要由肛周脓肿破溃后形成，少数由克罗恩病、结核等特殊感染或外伤引起。
肛周脓肿继发：脓肿未及时处理或引流不当，感染向肛门周围组织扩散，形成内口与外口间的瘘管。
特殊感染因素：克罗恩病、溃疡性结肠炎等炎症性肠病，或结核杆菌感染，可破坏肛周组织，诱发肛瘘。
医源性因素：肛门直肠手术中损伤或术后感染，可能导致局部组织纤维化，形成肛瘘。
外伤与异物：肛门直肠外伤、长期异物刺激（如缝线残留），可引发局部感染，逐渐发展为肛瘘。
特殊人群注意：糖尿病患者血糖控制不佳时，感染易扩散；婴幼儿肛周皮肤娇嫩，尿布更换不及时易引发肛周脓肿，需加强护理。
