双黄连的副作用主要包括胃肠道不适、过敏反应及其他罕见不良反应，通常发生在用药过程中或之后数小时至数天内，多数症状较轻，停药后可缓解。
胃肠道不适：部分人用药后可能出现恶心、呕吐、腹泻、腹痛等症状，尤其是空腹服用时更易发生，这与药物中的某些成分刺激胃肠道黏膜有关。
过敏反应：少数人可能出现皮疹、瘙痒、呼吸困难等过敏症状，严重过敏反应虽罕见但需警惕，一旦出现应立即停药并就医。
特殊人群风险：孕妇、哺乳期妇女、婴幼儿及肝肾功能不全者使用需谨慎，孕妇及哺乳期妇女应权衡利弊后遵医嘱使用，婴幼儿不建议自行使用。
其他罕见反应：极少数情况下可能出现头晕、头痛、胸闷等症状，若出现持续不适或异常反应，应及时咨询医生或药师。
