长期服用奥美拉唑可能出现头痛、腹泻等短期副作用，长期（通常超过1年）可能增加骨质疏松、维生素B12缺乏、社区获得性肺炎风险，还可能影响某些药物代谢。
消化系统影响：常见腹泻、便秘、恶心，长期使用可能导致胃黏膜细胞增生，增加肠道感染风险。
骨骼健康风险：长期使用可能降低钙吸收，增加骨质疏松和骨折风险，尤其老年女性需注意补充维生素D和钙。
营养吸收障碍：可能影响维生素B12、铁吸收，长期使用者建议定期监测血常规和电解质。
特殊人群注意：肝肾功能不全者需调整剂量，严重肾功能不全者禁用；孕妇哺乳期妇女慎用，儿童需严格遵医嘱，避免低龄儿童使用。
