疱疹性咽峡炎可能反复发生，尤其在免疫力低下或病毒未彻底清除时。
- 病毒未彻底清除：柯萨奇病毒A组等病原体感染后，病毒可能潜伏在细胞内，免疫力下降时重新激活。儿童、老年人及慢性病患者更易因免疫功能不足引发复发。
- 重复感染不同病毒株：多种病毒可引发该病，如肠道病毒、腺病毒等。感染后对特定病毒产生的抗体有限，可能再次感染其他病毒株，导致症状复发。
- 治疗不彻底或护理不当：仅对症退热可能掩盖症状，未清除病毒；未注意口腔卫生、饮食不当或接触感染源，易导致病毒残留或重复接触。
- 特殊人群风险：婴幼儿免疫系统未发育完全，易因反复接触感染源复发；糖尿病、HIV等患者免疫功能低下，需更严格防护，避免病毒反复感染。
预防与应对：日常需勤洗手、避免接触患者；感染后彻底治疗并注意口腔清洁；增强免疫力，均衡饮食、规律作息；特殊人群应减少去人群密集处，降低重复感染风险。
