甲亢药物存在副作用，发生率约为10%~30%，多数在用药初期1~3个月出现，部分可随治疗调整缓解。
血液系统副作用：可能出现白细胞减少、粒细胞缺乏，表现为易感染、发热，需定期监测血常规，尤其用药前3个月。
肝脏损伤：转氨酶升高或黄疸，慢性肝病患者风险更高，用药期间需监测肝功能，避免饮酒。
皮肤过敏：皮疹、瘙痒，严重者可能剥脱性皮炎，首次用药者需警惕，出现异常及时停药。
内分泌影响：甲状腺激素过度抑制，导致亚临床甲减，需定期复查甲功，调整剂量。
特殊人群注意：孕妇慎用甲巯咪唑，哺乳期妇女优先选择丙硫氧嘧啶；老年患者需降低剂量，避免肝肾功能负担。
