亚急性甲状腺炎治疗的药物主要为非甾体抗炎药、糖皮质激素（如泼尼松）及β受体阻滞剂。
非甾体抗炎药：适用于症状较轻的患者，可缓解疼痛、发热等炎症症状，通过抑制前列腺素合成发挥作用，如布洛芬、阿司匹林等。
糖皮质激素：用于症状严重、非甾体抗炎药效果不佳的患者，能快速减轻甲状腺炎症和疼痛，通常采用泼尼松口服，症状缓解后逐渐减量。
β受体阻滞剂：用于控制心动过速、心悸等交感神经兴奋症状，如普萘洛尔，适用于甲状腺毒症明显但无禁忌证的患者。
特殊人群提示：孕妇、哺乳期女性及儿童应优先选择非甾体抗炎药，避免使用糖皮质激素；糖尿病、高血压患者需在医生指导下用药，监测血糖、血压变化。
