肠道厌氧菌感染治疗以甲硝唑、克林霉素等抗菌药物为主，需根据感染部位与严重程度选择。
腹腔感染：首选甲硝唑联合头孢类抗生素，疗程通常7~14天，需注意孕妇及哺乳期女性禁用甲硝唑。
口腔感染：甲硝唑或克林霉素为常用药，局部可配合含漱液，儿童需在医生指导下调整剂量。
艰难梭菌感染：甲硝唑或万古霉素，需避免长期使用广谱抗生素，老年人需监测肾功能。
皮肤软组织感染：克林霉素或甲硝唑，糖尿病患者需控制血糖，注意感染部位清洁干燥。
特殊人群：孕妇禁用甲硝唑，哺乳期女性需暂停哺乳；肝肾功能不全者需调整用药剂量。
