HPV疫苗总体使用安全，大量临床研究显示其不良反应多为轻微短暂，上市后监测未发现累积性严重风险。
青少年人群接种后常见接种部位疼痛、红肿等局部反应，罕见头晕、发热等系统反应，均随时间自行缓解，无长期安全性隐患。
成年女性长期随访数据表明，接种后与未接种者在重大健康事件上无统计学差异，对已感染HPV的人群仍可预防其他亚型感染。
孕妇及哺乳期女性目前建议暂缓接种，待哺乳期结束或产后恢复后再行接种，以避免潜在未知影响。
特殊过敏体质者需提前告知医生过敏史，对疫苗成分严重过敏者禁止接种，其他过敏情况需在医生评估后决定是否接种。
