传染性软疣治愈后存在复发可能性，复发多发生在治疗后1~3个月内，与免疫力、皮肤屏障功能及再次接触病毒有关。
免疫力低下者复发风险高，如长期使用免疫抑制剂、患有免疫疾病或接受放化疗的人群，需加强免疫力监测与支持。
皮肤屏障功能未完全恢复时，易因微小皮肤破损再次感染，建议治愈后避免搔抓，保持皮肤清洁干燥，减少摩擦刺激。
治疗不彻底或未清除所有病毒颗粒时，病毒可能潜伏在表皮细胞内，待免疫力下降时重新增殖，需规范治疗至疣体完全消退。
特殊人群如婴幼儿、孕妇及老年人，应优先采用物理治疗（如夹除术），避免药物对皮肤的刺激，治疗后需密切观察皮肤恢复情况。
