扁平疣可外用维A酸类药膏（如维A酸乳膏）、水杨酸类药膏（如水杨酸软膏）、干扰素凝胶等。
维A酸类药膏通过调节角质形成细胞分化，抑制病毒复制，需坚持使用数周见效，孕妇及哺乳期女性禁用，儿童应在医生指导下使用。
水杨酸类药膏通过溶解角质、促进表皮更新发挥作用，可能引起轻微刺激，皮肤敏感者慎用，避免用于破损皮肤。
干扰素凝胶具有抗病毒和免疫调节作用，适合免疫力低下者，少数人可能出现局部轻微红肿，停药后可缓解。
激光、冷冻等物理治疗适用于顽固病例，治疗后需注意防晒和保湿，避免感染。日常应避免搔抓，减少皮肤刺激，增强免疫力有助于预防复发。
