复方沙棘籽油栓的副作用以外阴局部皮肤反应为主，如外阴皮肤瘙痒、丘疹或局部发红。
复方沙棘籽油栓作用于阴道及外阴局部，少数个体接触药物组分之后，会出现外阴皮肤瘙痒，同时可伴随丘疹生成，或是局部皮肤发红，这类表现属于用药后可观察到的副作用。该类局部反应发生占比并不高，多数人停止接触复方沙棘籽油栓之后，皮肤异常表现便可以逐步消退，不会持续造成损伤。
注意，外阴黏膜部位较为娇嫩，个体之间耐受能力各不相同，体质相对敏感的群体，出现这类局部应答的风险会有所上升。开展用药过程当中需要持续观察外阴皮肤状态，出现不适应当及时处理，要遵医嘱用药。
