在缺乏乳糖酶的情况下，人摄入的乳糖不能被消化吸收进血液，而是滞留在肠道。肠道细菌发酵分解乳糖的过程中会产生大量气体。造成腹胀、放屁。过量的乳糖还会升高肠道内部的渗透压，阻止对水分的吸收而导致腹泻。隔夜禁食后，口服一定量的乳糖水溶液。目前没有根治的方法。基本的对策包括避免摄入乳糖，或者用人造的乳糖酶药物来帮助消化。婴儿乳糖不耐受症状避免摄入乳糖因为各人消化乳糖的能力不同，摄入多少量以下的乳糖不引起症状主要靠实践中摸索来决定。最根本的方法是限量食用奶制品，以及含有奶制品的食物。豆浆、豆奶、杏仁奶、豆腐等产品可以部分替代乳制品的营养（尤其是蛋白质和钙），在价格上也比服用乳糖酶便宜很多。
