龟头起小水疱,则可能的原因:第一、真菌性的龟头炎,可以表现出龟头上境界清楚的红斑,红斑表面光滑,红斑周围可见小疱,伴随白色的分泌物,伴随局部的瘙痒、疼痛等表现。建议进行局部分泌物真菌涂片检查,来确定有无真菌感染。第二、滴虫性龟头炎,可以表现出境界清楚的红斑,红斑周围可有小疱,伴随急性渗出,伴随局部的疼痛等。多有过性接触而导致传播了滴虫感染,这是需要进行滴虫的相关检测病情,确诊后抗滴虫治疗。第三、疱疹病毒感染导致的,这时可以表现出龟头上局部呈簇状分布的水疱,伴随局部的疼痛,它也是经过性传播。水疱破裂以后可以导致表面糜烂,或者形成局部的疼痛、结痂等,需要进行疱疹病毒检测来确诊。