霉菌性食管炎是真菌感染造成的,这种情况下首先使用抗真菌的药物进行治疗,可以口服伊曲康唑、氟康唑等药物,但是真菌感染在治疗时效果不是特别好,而且使用药物的治疗周期相对是比较长的,在治疗过程当中一定要定期的进行肝肾功能检查,因为这些抗真菌的药物对肝功能、肾功能可能会有一定程度的损伤。此外就是要针对病人的全身情况来使用相应的药物治疗,霉菌性食管炎病人往往伴随免疫力的低下,可能和长时间使用激素类药物、免疫抑制剂甚至抗生素有关系,因此针对全身的症状也需要积极的药物治疗,如果霉菌性食管炎同时伴随胃酸反流烧心症状,也可以添加胃肠动力药和质子泵抑制剂。