已有调查资料显示食管癌可能是多种因素导致的的疾病。现阶段已经提出的病因有以下几个方面：1、化学病因，亚硝胺，亚硝胺这类化合物及其前体分布很广，它可以在体内外形成致癌性强的物质，在高发区的膳食，甚至患者的唾液中测亚硝酸盐含量均较低发区高。2、生物性的病因，真菌，在某些高发区的粮食中，食管癌患者的上消化道或者切除的食管癌标本上都能分离出多种真菌，其中某些真菌它有致癌作用，有些真菌能促使亚硝胺及其前体的形成更促进癌肿的发生。3、缺乏某些微量元素，主要是指钼、铁、锌、氟、硒在粮食、蔬菜、饮食中，在发病地区它的含量偏低。4、缺乏维生素，包括维生素A、维生素B2、维生素C以及动物蛋白，新鲜蔬菜或水果摄入不足是食管癌高发区的一个共同特点。5、烟、酒、吃热食、烫的食物、热饮、口腔不洁等因素，还有长时间饮烈性酒、抽烟食物过硬、过热、进食过快造成慢性刺激炎症，创伤、口腔不洁或龋齿等都可能和食管癌的发生有关。6、遗传因素，食管癌有家族性，有遗传易感因素。
