肺真菌病跟肺结核鉴别主要是针对浸润型肺结核进行鉴别，主要有以下几点：1、肺真菌病发生人群主要是慢性消耗性、免疫力低下或长时间使用免疫抑制剂的病人；而肺结核也可出目前这类人群身上，但是肺结核病人有结核病病人的接触史，这是不同的。2、肺真菌病病人起病比较急，病情比较重；肺结核是一个慢性疾病，会表现出结核中毒的症状，如发热、咳嗽、咳痰、咳血；3、影像学变化，肺真菌病病人胸片主要表现为中下肺叶病变，也可表现出菌球，易和结核病的空洞鉴别；肺结核病人胸片病变范围主要出目前双肺尖后段、下叶背段；4、肺真菌病试验室检查可能会找到真菌，如白色念珠菌一类；而肺结核试验室检查主要在涂片上找到结核菌，抗酸染色是阳性的，痰结核菌培养也是阳性的；5、治疗方面，肺真菌病主要是抗真菌治疗；肺结核治疗主要是抗痨、抗结核治疗。这是两者的主要区别。
