颅缝早闭的分类主要是根据导致颅缝发生早闭的病因来进行分类：首先，可以分为原发性颅缝早闭，多数情况下没有具体的发病原因，考虑为先天性遗传因素导致表现出的结果，会导致颅骨在子宫内生长发育异常。除了发生颅缝早闭以外，常常合并发生唇裂，腭裂等表现表现出。其次，考虑为代谢性颅缝早闭，比如说一些慢性消耗性疾病或营养障碍性疾病，比如佝偻病，甲状腺功能亢进和地中海贫血，特发性低钙血症都有可能会导致发生代谢性颅缝早闭。第三，考虑为医源性的因素所导致表现出，部分脑积水的患儿在接受了脑室腹腔分流手术以后，会继发性的导致颅缝早闭。
