第一，可行手术治疗，按照肿瘤的部位括约肌有无侵犯，以及腹股沟有无淋巴结转移而定，局部切除以齿状线下肛周癌，未超过肛周三分之一，又未侵犯括约肌时，可以行广泛性的局部切除。如果肿瘤直径小于2厘米，并且活动度较好，低度恶化者因肛中癌很少向直肠旁及肠系膜下血管旁淋巴结进行转移，至少要行环形的切除肿瘤边缘外2.5厘米皮肤。必须时切除一部分的肌肉，皮肤不能缝合应行植皮手术。第二，可行放射疗法，它可以根据病人的全身情况，及癌中的局部情况，使用x线体外放疗、镭放疗、电子加速器的放疗等等，术前应用放疗可提高切除率，术后应用放疗可以减少复发。第三，化学疗法，争光霉素对鳞状细胞癌和基底细胞癌均有疗效。
