引起咽喉炎的原因要分两类，一类是咽炎，一类是喉炎。咽是呼吸和消化共同的通道；喉主要是呼吸道的一部分。这两个都会因为比方急性的上呼吸道感染引起急性的咽喉炎，还有一些消化道的疾病，比方胃食管反流，胃液胃酸刺激咽喉部，会引起咽喉部的一些感染，引起咽喉部的症状。另外，一些临近的组织器官的疾病也会引起咽炎和喉炎，尤其是咽炎。比方慢性的鼻炎、鼻窦炎；慢性的牙龈炎、牙周炎会引起慢性咽炎。因为颈椎往前就是咽腔，咽后壁黏膜就直接覆盖在颈椎上，所以有一些颈椎病，颈椎骨质增生、颈椎曲度变直，也会有咽部的一些症状，主要是有咽炎的表现。
